به گزارش ايرنا از ستاد ويژه توسعه فناوري نانو، يك گروه بين المللي از دانشمندان دانشگاه صنعتي مونيخ (Technical University of Munich) به تازگي توانسته است با استفاده از روش هاي زيست انفورماتيك، يك قدم به كشف راز پروتئوم‌هاي تاريك (به تمام پروتئين هايي كه در يك سلول در يك زمان مشخص بيان مي شود، پروتئوم آن سلول گفته مي شود) نزديك شوند.
عملكرد اين پروتئين‌ها به طور قابل ملاحظه اي به وسيله ساختار سه بعدي آنها تعيين مي شود، با اين وجود پروتئين هايي وجود دارند كه به طور كامل و يا جزيي با ساختارهاي مشاهده شده از آزمايشات علمي قبلي تفاوت دارند در نتيجه نمي توان مدلي از ساختار آنها ارائه داد.
محققان به اين پروتئين‌ها و ساختارهاي سازنده آنها پروتئين هاي تاريك و يا پروتئوم تاريك مي گويند. اين نامگذاري مشابه نام ماده تاريك است كه در فضاي بيرون جو زمين يافت مي شود. تاكنون دانشمندان نمي دانستند چه تعداد از اين پروتئين ها بخشي از پروتئوم را تشكيل مي دهند ولي اكنون مي دانند كه نيمي از پروتئوم‌ها تاريك هستند.
دكتر آندريا شافرهانس از دانشكده زيست انفورماتيك دانشگاه مونيخ به همراه تيمي از موسسه سي اس آيرو (CSIRO) در سيدني و دانشگاه ليسبون (University of Lisbon)، خواص پروتئوم تاريك را مطالعه كردند. آنها اين كار را با انتخاب اطلاعات مشخصي از پايگاه‌هاي داده مختلف، ارتباط دادن آنها و ارزيابي اين اطلاعات انجام دادند.
پايگاه داده آكواريا (Aquaria) كه پروژه مشترك سي اس آيرو و دانشگاه مونيخ است، نقش مهمي در اين فرآيند ايفا كرده است، اين پايگاه در اوايل سال 2015 راه اندازي شد، اين وب سايت به محققان اجازه مي دهد به ساختارهاي سه بعدي توالي پروتئين ها (روشي براي تخمين توالي آمينو اسيد است) كه محاسبه شده‌اند؛ دسترسي داشته باشند.
پايگاه مزبور اين كار را با مراجعه به ساختارهاي موجود و استفاده از اين اطلاعات براي ساخت يك مدل محتمل براي ساختار جديد انجام مي دهد. اين وب‌سايت به محققان كمك مي كند تا تاريك بودن ساختارهاي پروتئين را تعيين كنند.
نتيجه اي كه ديده شد اين بود نيمي از پروتئوم تمام موجودات زنده‌اي كه سلول هايشان هسته دارند (شامل انسان‌ها نيز مي شود) بخشي از پروتئوم تاريك هستند.
همچنين دانشمندان توانستند خواص پيشر‌و را درباره پروتئين‌هاي تاريك شناسايي كنند؛ بيشتر پروتئين‌هاي تاريك كوتاه بوده، برهم كنش كمي با ديگر پروتئين‌ها داشته، اغلب دفع شده و تعداد كمي تركيب هاي جهش يافته دارند.
محققان همچنين يافتند كه بعضي از فرضيات گذشته در مورد پروتئين هاي تاريك اشتباه است. براي مثال، بيشتر پروتئين هاي تاريك پروتئين هايي با ساختار معيوب نيستند.
همچنين بيشتر پروتئين‌هاي تاريك، پروتئين‌هاي غشايي نيستند. پروتئين‌هاي غشايي در جداره‌اي كه اجزاي سلول يا تمام سلول‌ها را از هم جدا مي كند يافت مي شوند. تاكنون تصور مي شد كه اين دو فرض قادرند توضيح دهند كه چرا تعيين ساختار پروتئين‌هاي تاريك مشكل است.
دانشمندان با اين يافته‌ها كه در مجلهNational Academy of Sciences به چاپ رسيده است، مبناي مهمي بنا كرده اند كه به محققان براي بررسي بهتر مولكول‌هاي پروتئين ناشناخته در آينده كمك مي كند.
دانشمندان اميدوارند كه توجه بيشتري به موضوع پروتئوم تاريك جلب شود زيرا اين پروتئوم ممكن است حاوي پروتئين هايي باشد كه نقشي اساسي در سلامت انسان ايفا مي كنند.
علمي 9014**1581
تهران - ايرنا - دانشمندان به تازگي توانستند پايه و اساسي براي شناخت ساختار تعداد زيادي از پروتئين‌ها موسوم به پروتئين‌هاي تاريك را بيابند، پيش بيني مي شود اين پروتئين‌ها در سلامت انسان نقش مهمي داشته باشند.